Die Petrikirche ist die älteste und mit 117,0 m die höchste der ehemals vier Stadtkirchen der Hansestadt Rostock. Bis zum 31. Dezember 2025 gehörte sie wie die Marienkirche und die Petrikirche zur Evangelisch-Lutherischen Innenstadtgemeinde Rostock in der Propstei Rostock im Kirchenkreis Mecklenburg der Evangelisch-Lutherischen Kirche in Norddeutschland. Am 1. Januar 2026 fusionierten die Innenstadtgemeinde Rostock, die Slütergemeinde in Dierkow und die Michaelsgemeinde Gehlsdorf zur Jakobus-Kirchengemeinde Rostock.